A Universidade passou por muitas reformas administrativas e entre acordos e desacordos com os programas universitários do governo,tais como, PROUNI e FIES, prejudicando os alunos que cursavam no ano de 2006. Na época essas dificuldades repercutiram no encerramento de bolsas de estudo prejudicando a continuidade dos estudos dos acadêmicos.
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